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tcdB

Victor ID 4710
Gene Name tcdB
Sequence Strain (Species/Organism) Clostridium difficile 630
NCBI Gene ID 4914074
NCBI Protein GI 126698238
Locus Tag CD0660
Genbank Accession AM180355
Protein Accession YP_001087135
Taxonomy ID 272563
Gene Starting Position 787392
Gene Ending Position 794492
Gene Strand (Orientation) ?
Protein Name toxin B
Protein pI 4.15
Protein Weight 256310.6
Protein Length 2366
Protein Note Also known as toxB
DNA Sequence 
>gi|126697566:787392-794492 Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome
TATGAGTTTAGTTAATAGAAAACAGTTAGAAAAAATGGCAAATGTAAGATTTCGTACTCAAGAAGATGAA
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TACTTTAATGAGAATGGTGAAATGCAATTTGGTTATATAAATATAGAAGATAAGATGTTCTATTTTGGTG
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TTTGGATGAGAATTTTGAGGGAGAATCAATAAACTATACTGGTTGGTTAGATTTAGATGAAAAGAGATAT
TATTTTACAGATGAATATATTGCAGCAACTGGTTCAGTTATTATTGATGGTGAGGAGTATTATTTTGATC
CTGATACAGCTCAATTAGTGATTAGTGAATA
Protein Sequence 
>gi|126698238|ref|YP_001087135.1| toxin B [Clostridium difficile 630]
MSLVNRKQLEKMANVRFRTQEDEYVAILDALEEYHNMSENTVVEKYLKLKDINSLTDIYIDTYKKSGRNK
ALKKFKEYLVTEVLELKNNNLTPVEKNLHFVWIGGQINDTAINYINQWKDVNSDYNVNVFYDSNAFLINT
LKKTVVESAINDTLESFRENLNDPRFDYNKFFRKRMEIIYDKQKNFINYYKAQREENPELIIDDIVKTYL
SNEYSKEIDELNTYIEESLNKITQNSGNDVRNFEEFKNGESFNLYEQELVERWNLAAASDILRISALKEI
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LDENFEGESINYTGWLDLDEKRYYFTDEYIAATGSVIIDGEEYYFDPDTAQLVISE
Molecule Role Virulence factor
Molecule Role Annotation TOXIN: TcdB is cytotoxic and causes cells to die (Genth et al., 2008).
References