Search: for Help
About
Introduction
Statistics
Your PHIDIAS
Register or Login
Philert
Submission
Curated Data
Victors
BBP (Brucella)
Phinfo
Phinet
HazARD
Data Analysis
Phigen
Pacodom
BLAST
Help & Documents
Documents
FAQs
Links
Acknowledgements
Disclaimer
Contact Us
UMMS Logo

tcdA

Victor ID 4708
Gene Name tcdA
Sequence Strain (Species/Organism) Clostridium difficile 630
NCBI Gene ID 4914076
NCBI Protein GI 126698240
Locus Tag CD0663
Genbank Accession AM180355
Protein Accession YP_001087137
Taxonomy ID 272563
Gene Starting Position 795842
Gene Ending Position 803974
Gene Strand (Orientation) ?
Protein Name toxin A
Protein pI 5.42
Protein Weight 297192.75
Protein Length 2710
Protein Note Also known as toxA
DNA Sequence
>gi|126697566:795842-803974 Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome
TATGTCTTTAATATCTAAAGAAGAGTTAATAAAACTCGCATATAGCATTAGACCAAGAGAAAATGAGTAT
AAAACTATACTAACTAATTTAGACGAATATAATAAGTTAACTACAAACAATAATGAAAATAAATATTTAC
AATTAAAAAAACTAAATGAATCAATTGATGTTTTTATGAATAAATATAAAACTTCAAGCAGAAATAGAGC
ACTCTCTAATCTAAAAAAAGATATATTAAAAGAAGTAATTCTTATTAAAAATTCCAATACAAGCCCTGTA
GAAAAAAATTTACATTTTGTATGGATAGGTGGAGAAGTCAGTGATATTGCTCTTGAATACATAAAACAAT
GGGCTGATATTAATGCAGAATATAATATTAAACTGTGGTATGATAGTGAAGCATTCTTAGTAAATACACT
AAAAAAGGCTATAGTTGAATCTTCTACCACTGAAGCATTACAGCTACTAGAGGAAGAGATTCAAAATCCT
CAATTTGATAATATGAAATTTTACAAAAAAAGGATGGAATTTATATATGATAGACAAAAAAGGTTTATAA
ATTATTATAAATCTCAAATCAATAAACCTACAGTACCTACAATAGATGATATTATAAAGTCTCATCTAGT
ATCTGAATATAATAGAGATGAAACTGTATTAGAATCATATAGAACAAATTCTTTGAGAAAAATAAATAGT
AATCATGGGATAGATATCAGGGCTAATAGTTTGTTTACAGAACAAGAGTTATTAAATATTTATAGTCAGG
AGTTGTTAAATCGTGGAAATTTAGCTGCAGCATCTGACATAGTAAGATTATTAGCCCTAAAAAATTTTGG
CGGAGTATATTTAGATGTTGATATGCTTCCAGGTATTCACTCTGATTTATTTAAAACAATATCTAGACCT
AGCTCTATTGGACTAGACCGTTGGGAAATGATAAAATTAGAGGCTATTATGAAGTATAAAAAATATATAA
ATAATTATACATCAGAAAACTTTGATAAACTTGATCAACAATTAAAAGATAATTTTAAACTCATTATAGA
AAGTAAAAGTGAAAAATCTGAGATATTTTCTAAATTAGAAAATTTAAATGTATCTGATCTTGAAATTAAA
ATAGCTTTCGCTTTAGGCAGTGTTATAAATCAAGCCTTGATATCAAAACAAGGTTCATATCTTACTAACC
TAGTAATAGAACAAGTAAAAAATAGATATCAATTTTTAAACCAACACCTTAACCCAGCCATAGAGTCTGA
TAATAACTTCACAGATACTACTAAAATTTTTCATGATTCATTATTTAATTCAGCTACCGCAGAAAACTCT
ATGTTTTTAACAAAAATAGCACCATACTTACAAGTAGGTTTTATGCCAGAAGCTCGCTCCACAATAAGTT
TAAGTGGTCCAGGAGCTTATGCGTCAGCTTACTATGATTTCATAAATTTACAAGAAAATACTATAGAAAA
AACTTTAAAAGCATCAGATTTAATAGAATTTAAATTCCCAGAAAATAATCTATCTCAATTGACAGAACAA
GAAATAAATAGTCTATGGAGCTTTGATCAAGCAAGTGCAAAATATCAATTTGAGAAATATGTAAGAGATT
ATACTGGTGGATCTCTTTCTGAAGACAATGGGGTAGACTTTAATAAAAATACTGCCCTCGACAAAAACTA
TTTATTAAATAATAAAATTCCATCAAACAATGTAGAAGAAGCTGGAAGTAAAAATTATGTTCATTATATC
ATACAGTTACAAGGAGATGATATAAGTTATGAAGCAACATGCAATTTATTTTCTAAAAATCCTAAAAATA
GTATTATTATACAACGAAATATGAATGAAAGTGCAAAAAGCTACTTTTTAAGTGATGATGGAGAATCTAT
TTTAGAATTAAATAAATATAGGATACCTGAAAGATTAAAAAATAAGGAAAAAGTAAAAGTAACCTTTATT
GGACATGGTAAAGATGAATTCAACACAAGCGAATTTGCTAGATTAAGTGTAGATTCACTTTCCAATGAGA
TAAGTTCATTTTTAGATACCATAAAATTAGATATATCACCTAAAAATGTAGAAGTAAACTTACTTGGATG
TAATATGTTTAGTTATGATTTTAATGTTGAAGAAACTTATCCTGGGAAGTTGCTATTAAGTATTATGGAC
AAAATTACTTCCACTTTACCTGATGTAAATAAAAATTCTATTACTATAGGAGCAAATCAATATGAAGTAA
GAATTAATAGTGAGGGAAGAAAAGAACTTCTGGCTCACTCAGGTAAATGGATAAATAAAGAAGAAGCTAT
TATGAGCGATTTATCTAGTAAAGAATACATTTTTTTTGATTCTATAGATAATAAGCTAAAAGCAAAGTCC
AAGAATATTCCAGGATTAGCATCAATATCAGAAGATATAAAAACATTATTACTTGATGCAAGTGTTAGTC
CTGATACAAAATTTATTTTAAATAATCTTAAGCTTAATATTGAATCTTCTATTGGTGATTACATTTATTA
TGAAAAATTAGAGCCTGTTAAAAATATAATTCACAATTCTATAGATGATTTAATAGATGAGTTCAATCTA
CTTGAAAATGTATCTGATGAATTATATGAATTAAAAAAATTAAATAATCTAGATGAGAAGTATTTAATAT
CTTTTGAAGATATCTCAAAAAATAATTCAACTTACTCTGTAAGATTTATTAACAAAAGTAATGGTGAGTC
AGTTTATGTAGAAACAGAAAAAGAAATTTTTTCAAAATATAGCGAACATATTACAAAAGAAATAAGTACT
ATAAAGAATAGTATAATTACAGATGTTAATGGTAATTTATTGGATAATATACAGTTAGATCATACTTCTC
AAGTTAATACATTAAACGCAGCATTCTTTATTCAATCATTAATAGATTATAGTAGCAATAAAGATGTACT
GAATGATTTAAGTACCTCAGTTAAGGTTCAACTTTATGCTCAACTATTTAGTACAGGTTTAAATACTATA
TATGACTCTATCCAATTAGTAAATTTAATATCAAATGCAGTAAATGATACTATAAATGTACTACCTACAA
TAACAGAGGGGATACCTATTGTATCTACTATATTAGACGGAATAAACTTAGGTGCAGCAATTAAGGAATT
ACTAGACGAACATGACCCATTACTAAAAAAAGAATTAGAAGCTAAGGTGGGTGTTTTAGCAATAAATATG
TCATTATCTATAGCTGCAACTGTAGCTTCAATTGTTGGAATAGGTGCTGAAGTTACTATTTTCTTATTAC
CTATAGCTGGTATATCTGCAGGAATACCTTCATTAGTTAATAATGAATTAATATTGCATGATAAGGCAAC
TTCAGTGGTAAACTATTTTAATCATTTGTCTGAATCTAAAAAATATGGCCCTCTTAAAACAGAAGATGAT
AAAATTTTAGTTCCTATTGATGATTTAGTAATATCAGAAATAGATTTTAATAATAATTCGATAAAACTAG
GAACATGTAATATATTAGCAATGGAGGGGGGATCAGGACACACAGTGACTGGTAATATAGATCACTTTTT
CTCATCTCCATCTATAAGTTCTCATATTCCTTCATTATCAATTTATTCTGCAATAGGTATAGAAACAGAA
AATCTAGATTTTTCAAAAAAAATAATGATGTTACCTAATGCTCCTTCAAGAGTGTTTTGGTGGGAAACTG
GAGCAGTTCCAGGTTTAAGATCATTGGAAAATGACGGAACTAGATTACTTGATTCAATAAGAGATTTATA
CCCAGGTAAATTTTACTGGAGATTCTATGCTTTTTTCGATTATGCAATAACTACATTAAAACCAGTTTAT
GAAGACACTAATATTAAAATTAAACTAGATAAAGATACTAGAAACTTCATAATGCCAACTATAACTACTA
ACGAAATTAGAAACAAATTATCTTATTCATTTGATGGAGCAGGAGGAACTTACTCTTTATTATTATCTTC
ATATCCAATATCAACGAATATAAATTTATCTAAAGATGATTTATGGATATTTAATATTGATAATGAAGTA
AGAGAAATATCTATAGAAAATGGTACTATTAAAAAAGGAAAGTTAATAAAAGATGTTTTAAGTAAAATTG
ATATAAATAAAAATAAACTTATTATAGGCAATCAAACAATAGATTTTTCAGGCGATATAGATAATAAAGA
TAGATATATATTCTTGACTTGTGAGTTAGATGATAAAATTAGTTTAATAATAGAAATAAATCTTGTTGCA
AAATCTTATAGTTTGTTATTGTCTGGGGATAAAAATTATTTGATATCCAATTTATCTAATATTATTGAGA
AAATCAATACTTTAGGCCTAGATAGTAAAAATATAGCGTACAATTACACTGATGAATCTAATAATAAATA
TTTTGGAGCTATATCTAAAACAAGTCAAAAAAGCATAATACATTATAAAAAAGACAGTAAAAATATATTA
GAATTTTATAATGACAGTACATTAGAATTTAACAGTAAAGATTTTATTGCTGAAGATATAAATGTATTTA
TGAAAGATGATATTAATACTATAACAGGAAAATACTATGTTGATAATAATACTGATAAAAGTATAGATTT
CTCTATTTCTTTAGTTAGTAAAAATCAAGTAAAAGTAAATGGATTATATTTAAATGAATCCGTATACTCA
TCTTACCTTGATTTTGTGAAAAATTCAGATGGACACCATAATACTTCTAATTTTATGAATTTATTTTTGG
ACAATATAAGTTTCTGGAAATTGTTTGGGTTTGAAAATATAAATTTTGTAATCGATAAATACTTTACCCT
TGTTGGTAAAACTAATCTTGGATATGTAGAATTTATTTGTGACAATAATAAAAATATAGATATATATTTT
GGTGAATGGAAAACATCGTCATCTAAAAGCACTATATTTAGCGGAAATGGTAGAAATGTTGTAGTAGAGC
CTATATATAATCCTGATACGGGTGAAGATATATCTACTTCACTAGATTTTTCCTATGAACCTCTCTATGG
AATAGATAGATATATCAATAAAGTATTGATAGCACCTGATTTATATACAAGTTTAATAAATATTAATACC
AATTATTATTCAAATGAGTACTACCCTGAGATTATAGTTCTTAACCCAAATACATTCCACAAAAAAGTAA
ATATAAATTTAGATAGTTCTTCTTTTGAGTATAAATGGTCTACAGAAGGAAGTGACTTTATTTTAGTTAG
ATACTTAGAAGAAAGTAATAAAAAAATATTACAAAAAATAAGAATCAAAGGTATCTTATCTAATACTCAA
TCATTTAATAAAATGAGTATAGATTTTAAAGATATTAAAAAACTATCATTAGGATATATAATGAGTAATT
TTAAATCATTTAATTCTGAAAATGAATTAGATAGAGATCATTTAGGATTTAAAATAATAGATAATAAAAC
TTATTACTATGATGAAGATAGTAAATTAGTTAAAGGATTAATCAATATAAATAATTCATTATTCTATTTT
GATCCTATAGAATTTAACTTAGTAACTGGATGGCAAACTATCAATGGTAAAAAATATTATTTTGATATAA
ATACTGGAGCAGCTTTAATTAGTTATAAAATTATTAATGGTAAACACTTTTATTTTAATAATGATGGTGT
GATGCAGTTGGGAGTATTTAAAGGACCTGATGGATTTGAATATTTTGCACCTGCCAATACTCAAAATAAT
AACATAGAAGGTCAGGCTATAGTTTATCAAAGTAAATTCTTAACTTTGAATGGCAAAAAATATTATTTTG
ATAATGACTCAAAAGCAGTCACTGGATGGAGAATTATTAACAATGAGAAATATTACTTTAATCCTAATAA
TGCTATTGCTGCAGTCGGATTGCAAGTAATTGACAATAATAAGTATTATTTCAATCCTGACACTGCTATC
ATCTCAAAAGGTTGGCAGACTGTTAATGGTAGTAGATACTACTTTGATACTGATACCGCTATTGCCTTTA
ATGGTTATAAAACTATTGATGGTAAACACTTTTATTTTGATAGTGATTGTGTAGTGAAAATAGGTGTGTT
TAGTACCTCTAATGGATTTGAATATTTTGCACCTGCTAATACTTATAATAATAACATAGAAGGTCAGGCT
ATAGTTTATCAAAGTAAATTCTTAACTTTGAATGGTAAAAAATATTACTTTGATAATAACTCAAAAGCAG
TTACCGGATGGCAAACTATTGATAGTAAAAAATATTACTTTAATACTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGG
ATGGCAAACTATTGATGGTAAAAAATATTACTTTAATACTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGGATGGCAA
ACTATTGATGGTAAAAAATATTACTTTAATACTAACACTGCTATAGCTTCAACTGGTTATACAATTATTA
ATGGTAAACATTTTTATTTTAATACTGATGGTATTATGCAGATAGGAGTGTTTAAAGGACCTAATGGATT
TGAATATTTTGCACCTGCTAATACGGATGCTAACAACATAGAAGGTCAAGCTATACTTTACCAAAATGAA
TTCTTAACTTTGAATGGTAAAAAATATTACTTTGGTAGTGACTCAAAAGCAGTTACTGGATGGAGAATTA
TTAACAATAAGAAATATTACTTTAATCCTAATAATGCTATTGCTGCAATTCATCTATGCACTATAAATAA
TGACAAGTATTACTTTAGTTATGATGGAATTCTTCAAAATGGATATATTACTATTGAAAGAAATAATTTC
TATTTTGATGCTAATAATGAATCTAAAATGGTAACAGGAGTATTTAAAGGACCTAATGGATTTGAGTATT
TTGCACCTGCTAATACTCACAATAATAACATAGAAGGTCAGGCTATAGTTTACCAGAACAAATTCTTAAC
TTTGAATGGCAAAAAATATTATTTTGATAATGACTCAAAAGCAGTTACTGGATGGCAAACCATTGATGGT
AAAAAATATTACTTTAATCTTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGGATGGCAAACTATTGATGGTAAAAAAT
ATTACTTTAATCTTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGGATGGCAAACTATTGATGGTAAAAAATATTACTT
TAATACTAACACTTTCATAGCCTCAACTGGTTATACAAGTATTAATGGTAAACATTTTTATTTTAATACT
GATGGTATTATGCAGATAGGAGTGTTTAAAGGACCTAATGGATTTGAATACTTTGCACCTGCTAATACTC
ATAATAATAACATAGAAGGTCAAGCTATACTTTACCAAAATAAATTCTTAACTTTGAATGGTAAAAAATA
TTACTTTGGTAGTGACTCAAAAGCAGTTACCGGATTGCGAACTATTGATGGTAAAAAATATTACTTTAAT
ACTAACACTGCTGTTGCAGTTACTGGATGGCAAACTATTAATGGTAAAAAATACTACTTTAATACTAACA
CTTCTATAGCTTCAACTGGTTATACAATTATTAGTGGTAAACATTTTTATTTTAATACTGATGGTATTAT
GCAGATAGGAGTGTTTAAAGGACCTGATGGATTTGAATACTTTGCACCTGCTAATACAGATGCTAACAAT
ATAGAAGGTCAAGCTATACGTTATCAAAATAGATTCCTATATTTACATGACAATATATATTATTTTGGTA
ATAATTCAAAAGCAGCTACTGGTTGGGTAACTATTGATGGTAATAGATATTACTTCGAGCCTAATACAGC
TATGGGTGCGAATGGTTATAAAACTATTGATAATAAAAATTTTTACTTTAGAAATGGTTTACCTCAGATA
GGAGTGTTTAAAGGGTCTAATGGATTTGAATACTTTGCACCTGCTAATACGGATGCTAACAATATAGAAG
GTCAAGCTATACGTTATCAAAATAGATTCCTACATTTACTTGGAAAAATATATTACTTTGGTAATAATTC
AAAAGCAGTTACTGGATGGCAAACTATTAATGGTAAAGTATATTACTTTATGCCTGATACTGCTATGGCT
GCAGCTGGTGGACTTTTCGAGATTGATGGTGTTATATATTTCTTTGGTGTTGATGGAGTAAAAGCCCCTG
GGATATATGGCTA

Protein Sequence
>gi|126698240|ref|YP_001087137.1| toxin A [Clostridium difficile 630]
MSLISKEELIKLAYSIRPRENEYKTILTNLDEYNKLTTNNNENKYLQLKKLNESIDVFMNKYKTSSRNRA
LSNLKKDILKEVILIKNSNTSPVEKNLHFVWIGGEVSDIALEYIKQWADINAEYNIKLWYDSEAFLVNTL
KKAIVESSTTEALQLLEEEIQNPQFDNMKFYKKRMEFIYDRQKRFINYYKSQINKPTVPTIDDIIKSHLV
SEYNRDETVLESYRTNSLRKINSNHGIDIRANSLFTEQELLNIYSQELLNRGNLAAASDIVRLLALKNFG
GVYLDVDMLPGIHSDLFKTISRPSSIGLDRWEMIKLEAIMKYKKYINNYTSENFDKLDQQLKDNFKLIIE
SKSEKSEIFSKLENLNVSDLEIKIAFALGSVINQALISKQGSYLTNLVIEQVKNRYQFLNQHLNPAIESD
NNFTDTTKIFHDSLFNSATAENSMFLTKIAPYLQVGFMPEARSTISLSGPGAYASAYYDFINLQENTIEK
TLKASDLIEFKFPENNLSQLTEQEINSLWSFDQASAKYQFEKYVRDYTGGSLSEDNGVDFNKNTALDKNY
LLNNKIPSNNVEEAGSKNYVHYIIQLQGDDISYEATCNLFSKNPKNSIIIQRNMNESAKSYFLSDDGESI
LELNKYRIPERLKNKEKVKVTFIGHGKDEFNTSEFARLSVDSLSNEISSFLDTIKLDISPKNVEVNLLGC
NMFSYDFNVEETYPGKLLLSIMDKITSTLPDVNKNSITIGANQYEVRINSEGRKELLAHSGKWINKEEAI
MSDLSSKEYIFFDSIDNKLKAKSKNIPGLASISEDIKTLLLDASVSPDTKFILNNLKLNIESSIGDYIYY
EKLEPVKNIIHNSIDDLIDEFNLLENVSDELYELKKLNNLDEKYLISFEDISKNNSTYSVRFINKSNGES
VYVETEKEIFSKYSEHITKEISTIKNSIITDVNGNLLDNIQLDHTSQVNTLNAAFFIQSLIDYSSNKDVL
NDLSTSVKVQLYAQLFSTGLNTIYDSIQLVNLISNAVNDTINVLPTITEGIPIVSTILDGINLGAAIKEL
LDEHDPLLKKELEAKVGVLAINMSLSIAATVASIVGIGAEVTIFLLPIAGISAGIPSLVNNELILHDKAT
SVVNYFNHLSESKKYGPLKTEDDKILVPIDDLVISEIDFNNNSIKLGTCNILAMEGGSGHTVTGNIDHFF
SSPSISSHIPSLSIYSAIGIETENLDFSKKIMMLPNAPSRVFWWETGAVPGLRSLENDGTRLLDSIRDLY
PGKFYWRFYAFFDYAITTLKPVYEDTNIKIKLDKDTRNFIMPTITTNEIRNKLSYSFDGAGGTYSLLLSS
YPISTNINLSKDDLWIFNIDNEVREISIENGTIKKGKLIKDVLSKIDINKNKLIIGNQTIDFSGDIDNKD
RYIFLTCELDDKISLIIEINLVAKSYSLLLSGDKNYLISNLSNIIEKINTLGLDSKNIAYNYTDESNNKY
FGAISKTSQKSIIHYKKDSKNILEFYNDSTLEFNSKDFIAEDINVFMKDDINTITGKYYVDNNTDKSIDF
SISLVSKNQVKVNGLYLNESVYSSYLDFVKNSDGHHNTSNFMNLFLDNISFWKLFGFENINFVIDKYFTL
VGKTNLGYVEFICDNNKNIDIYFGEWKTSSSKSTIFSGNGRNVVVEPIYNPDTGEDISTSLDFSYEPLYG
IDRYINKVLIAPDLYTSLININTNYYSNEYYPEIIVLNPNTFHKKVNINLDSSSFEYKWSTEGSDFILVR
YLEESNKKILQKIRIKGILSNTQSFNKMSIDFKDIKKLSLGYIMSNFKSFNSENELDRDHLGFKIIDNKT
YYYDEDSKLVKGLININNSLFYFDPIEFNLVTGWQTINGKKYYFDINTGAALISYKIINGKHFYFNNDGV
MQLGVFKGPDGFEYFAPANTQNNNIEGQAIVYQSKFLTLNGKKYYFDNDSKAVTGWRIINNEKYYFNPNN
AIAAVGLQVIDNNKYYFNPDTAIISKGWQTVNGSRYYFDTDTAIAFNGYKTIDGKHFYFDSDCVVKIGVF
STSNGFEYFAPANTYNNNIEGQAIVYQSKFLTLNGKKYYFDNNSKAVTGWQTIDSKKYYFNTNTAEAATG
WQTIDGKKYYFNTNTAEAATGWQTIDGKKYYFNTNTAIASTGYTIINGKHFYFNTDGIMQIGVFKGPNGF
EYFAPANTDANNIEGQAILYQNEFLTLNGKKYYFGSDSKAVTGWRIINNKKYYFNPNNAIAAIHLCTINN
DKYYFSYDGILQNGYITIERNNFYFDANNESKMVTGVFKGPNGFEYFAPANTHNNNIEGQAIVYQNKFLT
LNGKKYYFDNDSKAVTGWQTIDGKKYYFNLNTAEAATGWQTIDGKKYYFNLNTAEAATGWQTIDGKKYYF
NTNTFIASTGYTSINGKHFYFNTDGIMQIGVFKGPNGFEYFAPANTHNNNIEGQAILYQNKFLTLNGKKY
YFGSDSKAVTGLRTIDGKKYYFNTNTAVAVTGWQTINGKKYYFNTNTSIASTGYTIISGKHFYFNTDGIM
QIGVFKGPDGFEYFAPANTDANNIEGQAIRYQNRFLYLHDNIYYFGNNSKAATGWVTIDGNRYYFEPNTA
MGANGYKTIDNKNFYFRNGLPQIGVFKGSNGFEYFAPANTDANNIEGQAIRYQNRFLHLLGKIYYFGNNS
KAVTGWQTINGKVYYFMPDTAMAAAGGLFEIDGVIYFFGVDGVKAPGIYG

Molecule Role Virulence factor
Molecule Role Annotation TOXIN: TcdA is cytotoxic and causes cells to die (Genth et al., 2008).
References