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HP0289

Victor ID 359
Gene Name HP0289
Sequence Strain (Species/Organism) Helicobacter
NCBI Gene ID 899197
NCBI Protein GI 15644917
Locus Tag HP0289
Protein Accession NP_207087.1
Other Database IDs UniProtKB-ID: O25063_HELPY
UniRef100: UniRef100_O25063
UniRef90: UniRef90_B2USC0
UniRef50: UniRef50_B6JKL8
UniParc: UPI00000D3097
EMBL: AE000511
EMBL-CDS: AAD07355.1
RefSeq_NT: NC_000915.1
DIP: DIP-3227N
MINT: MINT-162201
GenomeReviews: AE000511_GR
KEGG: hpy:HP0289
NMPDR: fig|85962.1.peg.285
TIGR: HP_0289
HOGENOM: HBG501636
OMA: NASFNNA
ProtClustDB: CLSK495972
Taxonomy ID 85962
Gene Starting Position 298023
Gene Ending Position 306704
Gene Strand (Orientation) +
Protein Name toxin-like outer membrane protein
DNA Sequence
>gi|15644634:298023-306704 Helicobacter pylori 26695, complete genome
AATGAAAAAGTTTAAAAAGAAACCAAAAAGTATCAAACGATCGCATCAAAATCAAAAAACAATCTTAAAG
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GGGGCTTAAGATGGGCTTGCAATACCAAGATATTAATATAACCGGGAATGTGGGCATGCGAGTGGCGTTT
TA
Protein Sequence
>gi|15644917|ref|NP_207087.1| toxin-like outer membrane protein [Helicobacter pylori 26695] MKKFKKKPKSIKRSHQNQKTILKRPLWLMPLLISGFASGVYANNLWDLLNPKVGGEYVHWVKGSQYCAWWEFAGCLKNVWGANHKGYDAGNAANYLSSQNYQAISVGSGNETGTYSLSGFTNYVGGNLTINLGNSVVLDLSGSNSFTSYQGYNQGKDDVTFTVGAINLNGTLEVGNRVGSGAGTHTGTATLNLNANKVNINSNINAYKTSQVNIGNANSVITIGSVSLSGDVCSSLASVGIGANCSTSGPSYSFKGTTNATNTAFSNASGSFTFEENATFSGAKWNGGTYTFNKEFSATNNTAFSSGSFNFKGVSSFNGTSFSNASYTFDNQATFQNSSFNGGTFTFNNQTNPTNNAQHPQIQNSSFSGNATTLKGFVNFQQAFNNSNHQLTIQNASFNNATFNNTGKITIEKDASFNNTTFNTSVDTNNMSVTGGVTLSGKNDLKNGSTLDFGSSKITLAQGTTFNLTSLGSEKSVTILNSSGGITYSNLLNHAINGLTSALKTNESLSNPQSFAQGLWDIITYNGVTGQLLNENAATSKPTDSSPSKSSTNSTQVYQVGYKIGDTIYKLQETFSHNSIIIQALESGTYTPPPVINGSKFDLSASNYINADMPWYDHKYYIPKSQNFTESGTYYLPSVQIWGSYTNSFKQTFSANGSNLVIGYNSTWTDHNVSSSGTVSFGDTSGSALNGHCGPWPYYQCTGTTNGTYSAYHVYITANLRSGNRIGTGGAANLIFNGVDSINIANATITQHNAGIYSSSMTFSTQSMDNSQNLNGLNSNGKLSVYGTTFTNEAKDGKFIFNAGQAVFENTNFNGGSYQFSGDSLNFSNNNQFNSGSFEISAKNASFNNANFNNSASFNFNNSNATTSFVGDFTNANSNLQIAGNAVFGNSTNGSQNTANFNNTGSVNISGNATFDNVVFNGPTNTSVKGQVTLNNITLKNLNAPLSFGDGTITFNAHSVINIAESITNGNPITLVSSSKEIEYNNAFSKNLWQLINYQGHGASSEKLVSSAGNGVYDVVYSFNNQTYNFQEVFSQNSISIRRLGVNMVFDYVDMEKSDHLYYQNALGFMTYMPNSYNNNLGNANNTIYYYDKSIDFYASGKTLFTKAEFSQTFTGQNSAIVFGAKSIWTSLSDAPQSNTIIRFGDNKGAGSNDASGHCWNLQCIGFITGHYEAQKIYITGSIESGNRISSGGGASLNFNGLQGILLTNATLYNRAAGTQSSSMNFISNSANIQAQNSYFIDDTAQNGGNPNFSFNALNLDFSNSSFRGYVGKTQSVFKFNAKNAISFTNSTNLSSGLYQMQAKSVLFDNSNLSVSVGTSSIKANAINLSQNASINASNHSTLELQGDLNVNDTSSLNLNQSTINVSNNATINDYASLIASNGSHLNFNGAVNFNSANITTSLNNSSIVFKGAVSLGGQFNLSNNSSLDFQGSSAITSNTAFNFYDNAFSQSPITFHQALDIKAPLSLGGNLLNPNNSSVLDLKNSQLVFGDQGSLNIANIDLLSDLNDNKNRVYNIIQADMNSNWYERISFFGMHINDGIYDAKNQTYSFTNPLNNALKITESFKDNQLSVTLSQIPGIKNTLYNIGSEIFNYQKVYNNANGVYSYSDDAQGVFYLTSNVKGYYNPNQSYQASGSNNTTKNNNLTSESSIISQTYNAQGNPISALHIYNKGYNFNNIKALGQMALKLYPEIKKVLGNDFSPSSLNALNSNALNQLTKLITPNDWKNINELIDNANNSVVQNFNNGTLIVGATQIGQTDTNSAVVFGGLGYQTPCDYTDIVCQKFRGTYLGQLLESSSADLGYIDTTFNAKEIYLTGTLGSGNAWGTGGSASVTFNSQTSLILNQANIVSSQTDGIFSMLGQEGINKVFNQAGLANILGEVAVQSINKAGGLGNLIVNTLGSNSVIGGYLTPEQKNQTLSQLLGQNNFDNLMNDSGLNTAIKDLIRQKLGFWTGLVGGLAGLGGIDLQNPEKLIGSMSINDLLSKKGLFNQITGFISANDIGQVISVMLQDIVKPSNALKNDVAALGKQMIGEFLGQDTLNSLESLLQNQQIKSVLDKVLAAKGLGPIYEQGLGDLIPNLGKKGLFAPYGLSQVWQKGDFSFNAQGNVFVQNSTFSNANGGTLSFNAGNSLIFAGNNHIAFTNHAGTLQLLSDQVSNINITTLNASNGLKINAANNNVSVSQGNLFVSASCAQQSDPTTANIANPCALSAQSTNGASSNNASNNAPIALSNNDESLMVAANDFNFSGNIYANGVVDFSKIKGSANIKNLYLYNNAQFQANNLTISNQAVLEKNASFVTNNLNIQGAFNNNATQKIEVLQNLVIASNASLSTGIYGLEVGGALNNSGAIHFNLENTQTPTPLIQAEGIINLNTTQTPFMNVNNSMANNTTYTLLKSSRYIDYNINPNSLQSYLNLYTLININGNHIEEKNGALTYLGQRVLLQDKGLLLSVALPNSNNASQNNILSLSVLYNQVKMSCGDKAMDFTPPTLQDYIVGIQGQSALNQIEAVGGNAIKWLSTLMMETKENPFFAPIYLKNHSLNEILGVTKDLQNTASLISNPNFRDNATNLLELASYTQQTSRLTKLSDFRSREGESDFSLLELKNKRFSDPNPEVFVKYSQLSKHPNNLWVQGVGGASFISGGNGTLYGLNAGYDRLVKNVILGGYVAYGYSDFNGNIMHSLGNNVDVGMYARAFLKRNEFTLSANETYGGNATSINSSNSLLSVLNQRYNYNTWTTSVNGNYGYDFMFKQKSVVLKPQVGLSYHFIGLSGMKGNDAAYKQFLMHSNPSNESVLTLNMGLESRKYFGKNSYYFVTARLGRDLLIKSKGSNTVRFVGENTLLYRKGEVFNTFASVITGGEMHLWRLVYVNAGVGLKMGLQYQDINITGNVGMRVAF
Molecule Role Virulence factor
Molecule Role Annotation MUTATION: a HP0289 mutant was attenuated for gastric colonization in a gerbil model (Kavermann et al., 2003)
COG COG5651N, under N: Cell motility
References
Kavermann et al., 2003: Kavermann H, Burns BP, Angermuller K, Odenbreit S, Fischer W, Melchers K, Haas R. Identification and characterization of Helicobacter pylori genes essential for gastric colonization. The Journal of experimental medicine. 2003; 197(7); 813-822. [PubMed: 12668646].